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HPLCを用いたcircRNAの精製

円形RNA、またはcircRNAは、形状が異なる特定の種類のRNAです。通常のRNAは直線的な形状をしているのに対し、circRNAはループ状です。circRNAの構造は重要で、これらは豊富に存在し、多くの重要な細胞プロセスに関与しています。例えば、私たちの遺伝子の発現を調整し、これは体の成長パターンから疾患への反応まで、あらゆることに影響を与える可能性があります。circRNAは科学者にとって非常に興味深い対象であり、それらをより深く理解することで、疾患の発生メカニズムが明らかになり、新しい治療法が見つかる可能性があります。しかし、問題があります:circRNAは非常に小さく、科学者が研究するサンプル中に非常に少量しか存在しません。これにより、研究のために十分な量のcircRNAを採取することが困難になります。

確定的なcircRNA収集の基盤が確立される前は、高性能液体クロマトグラフィーと呼ばれる確立された方法、略してHPLCが使用されていました。HPLCは、分子の物理的および化学的特性に基づいてさまざまな分子を分離するための多用途な技術です。これは、サイズや形状に基づいて分子を分離することによって動作します。circRNAは非常に小さいため、サンプル内の他の数千の分子に紛れて失われることがあります。これにより、サイズ排阻クロマトグラフィー(SEC)などの効果的な方法、つまりHPLC技術を使用することで、サンプル内に含まれる可能性のある他のRNA、タンパク質、外部由来の不純物からcircRNAを分離することができます。研究のためにcircRNAを分離する必要がある科学者にとって、これは重要な分離工程です。

HPLCを基盤としたcircRNA分離で正確なダウンストリーム解析を実現

HPLCがcircRNAの精製を支援すると、科学者たちはその機能を理解するためにそれを徹底的に分析する必要があります。 CircRNAは、複数の生物学的機能に関与する重要な分子として注目されており、さまざまなCircRNAの種類や役割を完全に理解することは、多様な疾患におけるその関与を解明する上で重要です。 科学者たちは、精製されたcircRNAの配列を知らず、その役割の機能を発見するためにそれを知る必要があります。 そのため、逆転写PCR(RT-PCR)などの技術を利用します。 RT-PCRを使用して、科学者たちはcircRNAの追加コピーを作成し、それをより具体的に研究することができます。 彼らは、これらの分子がどのように機能し、私たちの細胞で何をしているかについての情報を提供することがよくあります。これは、circRNAの配列を解析することによって得られます。

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