Strategie di ottimizzazione dei codoni

Esistono 64 codoni genetici, di cui 60 codificano 20 aminoacidi. Ogni organismo utilizzato per l'espressione o la produzione di proteine (inclusi Escherichia coli, lieviti, cellule mammaliane, Pichia, cellule vegetali e cellule insettine) mostra un certo grado di differenza o preferenza nell'uso dei codoni. I codoni più frequentemente utilizzati in un organismo ospite sono chiamati codoni ottimali, mentre quelli poco usati sono chiamati codoni rari o di bassa frequenza.

Ottimizzazione dei Codoni

L'ottimizzazione dei codoni prevede la modifica di una sequenza genica utilizzando i codoni preferiti ed evitando quelli di bassa frequenza o rari, e poi ottenendo il gene modificato attraverso la sintesi genica. Questo ridisegno dei geni è noto come ottimizzazione dei codoni.

Una sequenza genica ottimizzata può migliorare la stabilità della struttura secondaria dell'mRNA, prevenendo ritardi nella traduzione, interruzioni premature della traduzione, spostamenti del quadro di lettura e errori di accoppiamento degli aminoacidi dovuti a pool di tRNA insufficienti.

L'ottimizzazione è significativa perché facilita il progresso efficiente di processi come la sintesi genica, la costruzione del vettore, la trascrizione e la traduzione.

Fattori di Ottimizzazione

Bilanciamento del contenuto GC: Questo influisce sulla stabilità del legame, sulla temperatura di annealing e sul rendimento proteico.

Riduzione delle sequenze ripetute: Questo riduce la difficoltà della sintesi genica.

Regolazione della struttura secondaria dell'mRNA: Per evitare strutture a capello che influenzano la traduzione.

Eliminazione dei siti di taglio degli enzimi di restrizione : Per proteggere l'integrità del gene.

Preferenza del codone: Ottimizzazione del gene donatore in base all'ospite per massimizzare l'espressione proteica.

Supporto di Yaohai

Per la progettazione e sintesi dei geni, l'espressione proteica e l'ottimizzazione dei codoni da soli non sono sufficienti. Metodi e programmi diversi possono progettare e produrre sequenze mRNA ottimizzate con codoni differenti. Basandosi sui fattori di ottimizzazione sopracitati, combinati con il proprio database ufficiale e riassumendo anni di esperienza nella sintesi genica, Yaohai Bio-Pharma ha sviluppato il suo unico database di ottimizzazione dei codoni. Può fornirle ottimizzazione gratuita dei codoni e progettazione di schemi di sintesi genica per massimizzare l'ottimizzazione della sequenza genica.

Yaohai Bio-Pharma ha stabilito un insieme completo di tecnologie di sintesi di mRNA lineare e circolare per fornire RNA di alta qualità, come progettazione e ottimizzazione delle sequenze, sintesi genica, IVT, ciclizzazione, purificazione dell'RNA e incapsulamento LNP.

Stiamo cercando attivamente partner globali istituzionali o individuali. Offriamo la compensazione più competitiva del settore. Se hai domande, non esitare a contattarci: [email protected]

Per maggiori dettagli su Yaohai Bio-Pharma, consultate il nostro sito web: www.yaohaibio-pharma.com