Στρατηγικές Βελτιωμένων Κώδων

Υπάρχουν 64 γενετικοί κωδόνες, από τους οποίους 60 κωδικεύουν 20 αμινοξέα. Κάθε οργανισμός που χρησιμοποιείται για την έκφραση ή παραγωγή πρωτεΐνων (συμπεριλαμβανομένων Escherichia coli, μάιτσας, ευτοξείων κυττάρων, Pichia, φυτικών κυττάρων και εντομικών κυττάρων) εμφανίζει μερικό βαθμό διαφοράς ή προτίμησης στη χρήση κωδόνων. Οι κωδόνες που χρησιμοποιούνται πιο συχνά σε έναν φιλοξενούσαν ονομάζονται αιχματικοί κωδόνες, ενώ αυτοί που χρησιμοποιούνται λιγότερο ονομάζονται σπάνιοι ή κωδόνες με χαμηλή χρήση.

Βελτιστοποίηση Κωδόνων

Η βελτιστοποίηση κωδόνων περιλαμβάνει την τροποποίηση μιας γενετικής ακολουθίας με τη χρήση προτιμώμενων κωδόνων και την αποφυγή κωδόνων με χαμηλή χρήση ή σπάνιων κωδόνων, και μετά την απόκτηση της τροποποιημένης γενετικής με τη σύνθεση γονιδίων. Αυτή η αναμόρφωση των γονιδίων ονομάζεται βελτιστοποίηση κωδόνων.

Μια βελτιστοποιημένη γενετική ακολουθία μπορεί να ενισχύσει τη σταθερότητα της δευτερεύουσας δομής του mRNA, προλεγώντας καθυστερήσεις μετάφρασης, πρόωρη διακοπή μετάφρασης, μετατοπισμό μετάφρασης και μη προβλεπόμενες αντιστοιχίες αμινοξέων λόγω ελλιπών πιστώσεων tRNA.

Η βελτιστοποίηση είναι σημαντική γιατί επιτρέπει την αποδεκτή πρόοδο των διεργασιών όπως η σύνθεση γονιδίου, η κατασκευή διαφορέα, η μεταφορά και η μετάφραση.

Παράγοντες Βελτιστοποίησης

Ισορροπία του περιεχομένου GC: Αυτό επηρεάζει τη σταθερότητα δεσμού, τη θερμοκρασία αναδιπλούσας και την απόδοση πρωτεΐνης.

Μείωση επαναλαμβανόμενων ακολουθιών: Αυτό μειώνει τη δυσκολία της σύνθεσης γονιδίου.

Συμπλοκή δευτερεύουσας δομής mRNA: Για να αποφεύγονται οι δομές κουρεμού που επηρεάζουν τη μετάφραση.

Αφαίρεση των σημείων κοπής ενζυμάτων περιορισμού : Για να προστατεύεται η ακεραιότητα του γονιδίου.

Προτίμηση κώδωνα: Οπτιμοποίηση του δωρεάδικου γονιδίου σύμφωνα με τον ξενιστή για να μεγιστοποιηθεί η έκφραση πρωτεΐνης.

Υποστήριξη του Yaohai

Για την σχεδίαση και σύνθεση γονιδίων, η απλή έκφραση πρωτεΐνης και η οπτιμοποίηση κώδωνα δεν είναι αρκετές. Διαφορετικές μεθόδεις και προγράμματα μπορούν να σχεδιάσουν και να παράγουν διαφορετικές κώδωνα-οπτιμοποιημένες αλληλουχίες mRNA. Βάσει των παραπάνω παραγόντων οπτιμοποίησης, συνδυασμένων με την επίσημη βάση δεδομένων τους και περιλαμβανομένων ετών εμπειρίας στη σύνθεση γονιδίων, το Yaohai Bio-Pharma έχει αναπτύξει την δική του μοναδική βάση δεδομένων οπτιμοποίησης κώδωνα. Μπορεί να σας προσφέρει δωρεάν οπτιμοποίηση κώδωνα και σχεδιασμό συνθέσεως γονιδίων για να μεγιστοποιηθεί η οπτιμοποίηση της αλληλουχίας του γονιδίου σας.

Το Yaohai Bio-Pharma έχει αναπτύξει ένα ολοκληρωμένο σύνολο τεχνολογιών σύνθεσης γραμμικού mRNA και κυκλικού mRNA για να παρέχει υψηλής ποιότητας RNA, όπως η σχεδίαση και η οπτιμοποίηση αλληλουχίας, η σύνθεση γονιδίων, IVT, κυκλοποίηση, καθαρισμός RNA και περιβάλλον LNP.

Επιζητούμε ενεργά παγκόσμιους συνεργάτες, ιδρύματα ή μεμονωμένες οντότητες. Προσφέρουμε την πιο ανταγωνιστική αποζητητική στον τομέα. Εάν έχετε κάποιες ερωτήσεις, μην διστάσετε να μας επικοινωνήσετε: [email protected]

Για περισσότερες λεπτομέρειες για το Yaohai Bio-Pharma, παρακαλώ αναφερθείτε στην ιστοσελίδα μας: www.yaohaibio-pharma.com